轉(zhuǎn)錄組測序
1. 普通轉(zhuǎn)錄組測序
轉(zhuǎn)錄組是指某個物種或特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下產(chǎn)生的所有RNA的總和，包括mRNA和非編碼RNA（Non-coding RNA）。目前研究較多的非編碼RNA又包括：circRNA,，miRNAs,，及lncRNAs等?；诟咄繙y序平臺的轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)能夠全面獲得物種特定組織或器官的轉(zhuǎn)錄本信息,，從而進(jìn)行基因表達(dá)水平研究、新轉(zhuǎn)錄本發(fā)現(xiàn)研究,、轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)變異研究等,。
北京嘉程生物科技有限公司的普通轉(zhuǎn)錄組測序主要針對mRNA和miRNAs。
2. 長鏈非編碼RNA測序
長鏈非編碼RNA測序(long non-coding RNA Sequencing,，lncRNA Sequencing),。
長鏈非編碼RNA是一類長度大于200 nt且不編碼蛋白質(zhì)的RNA（不含rRNA），廣泛存在于各種生物體內(nèi),。lncRNA參與表觀遺傳,、轉(zhuǎn)錄以及轉(zhuǎn)錄后等多水平的調(diào)控過程，在生命活動中具有重要作用,。lncRNA測序,，使用高通量測序技術(shù)結(jié)合先進(jìn)的生物信息學(xué)分析，一次性獲得樣本中幾乎全部的lncRNA信息,，為全面,、深入地研究lncRNA的功能提供了全新的工具。
3. 三代全長轉(zhuǎn)錄組測序
三代全長轉(zhuǎn)錄組測序,，即利用PacBio三代測序平臺對某一物種的mRNA進(jìn)行測序研究,。它以平均超長讀長10-15kb的優(yōu)勢、結(jié)合多片段文庫篩選技術(shù),，實現(xiàn)了無需拼接的轉(zhuǎn)錄本分析,，克服了傳統(tǒng)二代轉(zhuǎn)錄組Unigene拼接較短、轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)不完整的缺陷,，也由于其可直接獲得單個RNA分子從5’端到3’端的高質(zhì)量全部轉(zhuǎn)錄組信息,。
目前基于PacBio的單分子實時測序技術(shù)，目前平均讀長已經(jīng)達(dá)到10Kb以上,，最長可達(dá)80Kb,，轉(zhuǎn)錄組測序不再需要組裝,，就可以直接得到全長轉(zhuǎn)錄本的信息。