小麥全外顯子捕獲測序
外顯子組測序（Exome Sequencing)是指利用靶向捕獲技術(shù)將全基因組外顯子區(qū)域捕獲并富集后進(jìn)行高通量測序的基因組分析方法,。
通過高通量測序技術(shù)進(jìn)行外顯子組測序,，能夠直接發(fā)現(xiàn)與蛋白功能變異相關(guān)的遺傳突變和直接對(duì)基因功能相關(guān)的編碼序列進(jìn)行研究,，大大減少了測序費(fèi)用,。
相比于全基因組重測序,，外顯子組測序更加經(jīng)濟(jì),、高效,、深入,。
簡化外顯子組測序（cSNP-Sequencing)相對(duì)于基因芯片,，能夠提供更為完整的變異信息以及變異位點(diǎn)附近的序列信息,，超高密度的標(biāo)記數(shù)置，11萬High Confidence基因覆蓋,，大于600K cSNP,、InDel,、CNV等變異檢測。
小麥全外顯子測序,，全新260M/300M目標(biāo)捕獲區(qū)間設(shè)計(jì),，覆蓋超過15萬/16萬個(gè)基因。
產(chǎn)品設(shè)計(jì)：
1,、 基于IWGSC參考基因組及基因注釋設(shè)計(jì),；基于AKS8基因組及注釋設(shè)計(jì)。
2,、 增加3000+份小麥轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)注釋,，包含所有組織及發(fā)育時(shí)期。
3,、 增加20+份Pacbio三代全長轉(zhuǎn)錄本測序數(shù)據(jù)進(jìn)行基因組注釋,。
4、 增加100+份LncRNA深度測序數(shù)據(jù)進(jìn)行長鏈非編碼基因注釋,。
捕獲：
目標(biāo)區(qū)域> 260M/300M 捕獲基因數(shù)> 15萬/16萬
優(yōu)化
1,、深度基因區(qū)域覆蓋，確保突變位點(diǎn)的真實(shí)性,；
2,、超冗余探針設(shè)計(jì)，保證目標(biāo)區(qū)域有效捕獲,；
3,、多重探針密度校正，保證捕獲的均一性,；
4,、多重捕獲技術(shù)，保證捕獲樣品的隨機(jī)性,。
樣品準(zhǔn)備
突變體群體,、自然群體、組圖群體材料
| 樣品類型 | 數(shù)量要求 | 存放形式 |
樣品要求 | 組織樣品 | ≥2cm葉片 | 1.5mL 離心管 |
DNA樣品 | ≥2μg DNA | 0.2mL EP管 |
BSA基因定位材料
質(zhì)量性狀群體,，每個(gè)極端性狀混池≥25個(gè)極端個(gè)體材料 |
數(shù)量性狀群體,，每個(gè)極端性狀混池≥35個(gè)極端個(gè)體材料 |
| 樣品類型 | 數(shù)量要求 | 存放形式 |
樣品要求 | 組織樣品 | ≥2cm葉片 | 1.5mL 離心管 |
DNA樣品 | ≥2μg DNA | 0.2mL EP管 |
RNA樣品 | ≥2μg 總RNA | 0.2mL EP管 |